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從代謝組學(xué)到神經(jīng)酸
文章作者:admin
更新時(shí)間:2020-7-24 9:55:26
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  9月24日-25日,寶楓生物與國家衛(wèi)建委職業(yè)衛(wèi)生研究中心、宣武醫(yī)院、天津眼科醫(yī)院、中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院、沃特世(上海)等合作單位,開展代謝組學(xué)基礎(chǔ)及代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的內(nèi)部培訓(xùn)。


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寶楓生物CTO陳顯揚(yáng)博士(第二排,右二)、職業(yè)衛(wèi)生中心實(shí)驗(yàn)室人員(第二排,右三)、天津眼科醫(yī)院危平輝醫(yī)生(第二排,右一)、宣武醫(yī)院李旭穎醫(yī)生(左一)


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天津眼科醫(yī)院韓國鴿(中)

代謝組學(xué)(Metabolomics) 是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后發(fā)展起來的新興的組學(xué)技術(shù),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,據(jù)統(tǒng)計(jì),近些年來代謝組學(xué)的研究越來越活躍,美國國家健康研究所(NIH)將代謝組學(xué)的發(fā)展規(guī)劃納入了國家生物技術(shù)發(fā)展的路線圖計(jì)劃中,許多國家的科研單位也先后開展了代謝組學(xué)的研究工作。


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寶楓生物的陳顯揚(yáng)博士向大家詳細(xì)的講解了代謝組學(xué)中的各種問題。陳顯揚(yáng)博士指出代謝組學(xué)研究產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)具有高維、小樣本、高噪聲等復(fù)雜特征。如何從復(fù)雜的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)中提取出有價(jià)值的信息,篩選出潛在的生物標(biāo)志物成為近年來代謝組學(xué)研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)


首先要進(jìn)行的是樣本數(shù)據(jù)的預(yù)處理,處理手段主要包括歸一化(normalizationn) 、標(biāo)準(zhǔn)化(scaling) 。在代謝組學(xué)研究中通常用單變量分析方法來快速考察各個(gè)代謝物在不同類別之間的差異。但在處理時(shí)需考慮多重假設(shè)檢驗(yàn)的問題,常用的方法為Bonferion校正和局部FDR。而代謝組學(xué)產(chǎn)生的是高維的數(shù)據(jù),因此多變量統(tǒng)計(jì)分析在代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析中具有重要的作用。代謝組學(xué)數(shù)據(jù)采用的多變量統(tǒng)計(jì)分析方法主要有偏最小二乘判別分析(PLS-DA) 、基于正交信號校正的偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN) 、支持向量機(jī)(SVM) 等。


 代謝組學(xué)分析的最終目標(biāo)是希望從中篩選出潛在的生物相關(guān)標(biāo)志物,從而探索其中的生物代謝機(jī)制。比較常見的一種策略是先進(jìn)行單變量分析,再結(jié)合多變量模型中變量重要性評分作為篩選標(biāo)準(zhǔn),如挑選fdr≤0.05和VIP>1.0的變量作為潛在生物標(biāo)志物。用篩選的潛在生物標(biāo)志物對外部測試數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)測,評價(jià)其預(yù)測效果。最后,可以通過研究生物標(biāo)志物的生物學(xué)功能和代謝通路,分析不同生物標(biāo)志物之間的相互作用和關(guān)系,從而為探索生物代謝機(jī)制提供重要線索和信息。


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代謝組學(xué)作為后基因時(shí)代的一門新興學(xué)科,近年來的發(fā)展已經(jīng)顯示出該學(xué)科的應(yīng)用和發(fā)展前景。它與藥物的藥效、毒性篩選、評價(jià)研究、安全性評價(jià)、作用機(jī)制研究和合理用藥密切相關(guān)。從代謝組學(xué)的整體觀念與作用的整體觀念的一致性的認(rèn)識,它適于疾病的早期診斷、預(yù)防和治療效果的評估等一系列的方向。


       寶楓生物的神經(jīng)酸研究和開發(fā),也完全借鑒了代謝組學(xué)的手段,通過超高分辨飛行時(shí)間質(zhì)譜的檢測,鑒定了神經(jīng)酸適合吸收和發(fā)揮作用的骨架結(jié)構(gòu);同時(shí),利用靶向代謝組學(xué)的手段,證明了神經(jīng)酸是諸多腦疾病的重要分子標(biāo)志物,具有極大的藥用潛力;以比較基因組學(xué)和代謝組學(xué)的研究為基礎(chǔ),寶楓生物開發(fā)了一系列的復(fù)合配方產(chǎn)品,填補(bǔ)了市場上的腦保健食品空白。



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